计算机科学 ›› 2007, Vol. 34 ›› Issue (5): 215-217.

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基于“快速投票”算法的HMM/SVM混合识别模型及应用

  

  • 出版日期:2018-11-16 发布日期:2018-11-16
  • 基金资助:
    国家自然科学基金资助项目(No.10371135).

  • Online:2018-11-16 Published:2018-11-16

摘要: 提出一种基于隐马尔可夫模型(HMM)和支持向量机(SVM)的双层过滤识别系统。根据隐马尔可夫模型训练中不同结构的序列其L值分布范围不同的特点,对传统多类“投票模型”进行改进,提出一种“快速投票”算法。先用HMM对人类内含子和外显子进行识别,同时,对于L值区域有重叠造成识别率较低的部分,再用支持向量机进行第二次识别过滤。这一模型克服了传统用单一HMM识别方法的不足,实现了HMM和SVM的优势互补。实验表明,用HMM/SVM进行两类识别,其平均识别率达到了90%,进行多类识别,平均识别率达到了91.5%。

关键词: HMM/SVM模型 “快速投票”方法 内含子和启动子识别

Abstract: Propose a kind of HMM/SVM double layer filter recognition system. According to the characteristic that the L value is different while the sequence structure is different in the HMM training, improve the traditional "voting model",put forward a "Fast Votin

Key words: HMM/SVM models, "Fast voting" algorithm, Intron and promoter recognition

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