计算机科学 ›› 2007, Vol. 34 ›› Issue (7): 197-199.
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李小妹
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LI Xiao-Mei （Faculty of Computer, Guangdong University of Technology, Guangzhou 510006）
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摘要： PERM算法是当前蛋白质结构预测的格子模型优化算法中最为有效的一种算法，在该算法的基础上，我们提出了一种改进的增长算法IPERM。该方法简化了PERM算法中的权重计算公式，在遇到不同类型的残基时选用不同的上下限阂值以提高算法的有效性，并根据链长的大小使用不同的网格尺寸。实验结果表明，改进的增长算法使得HP序列在格子模型中能更快地找到其能量最低构象。
关键词: 蛋白质折叠 格子模型 PERM
Abstract: PERM is the most efficient aproach for protein folding problem in lattice model. In this paper we ppresent an improved growth algorithm which simplify the calculation of weight when choosing different branches and apply different upper thresholds accordin
Key words: Protein folding, Lattice model, PERM
李小妹. 蛋白质在格子模型中改进的PERM算法[J]. 计算机科学, 2007, 34(7): 197-199. https://doi.org/
LI Xiao-Mei （Faculty of Computer, Guangdong University of Technology, Guangzhou 510006）. [J]. Computer Science, 2007, 34(7): 197-199. https://doi.org/
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