计算机科学 ›› 2008, Vol. 35 ›› Issue (4): 181-183.
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何静媛 何中市 邹东升
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HE Jing-Yuan, HE Zhong-Shi, ZOU Dong-Sheng （College of Computer Science, Chongqing University, Chongqing 400044）
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摘要： RNA二级结构预测问题是生物信息学的一个研究重点，本文主要利用支持向量机（SVM）模型来研究RNA二级结构预测问题。通过改进NSSEL标签，形成了能表示平面伪结结构的E-NSSEL标签，该标签作为SVM模型输出端的类别标识，因此，测试序列经过SVM模型预测后得到相应的E-NSSEL序列，该序列可以恢复为二级结构。此算法能有效地解决传统算法中存在的时间复杂性的问题和长链分子的预测问题。
关键词: SVM E-NSSEL标签 RNA二级结构 平面伪结
Abstract: One of the most important research areas in bioinformatics is RNA secondary structure prediction This paper introduces a new representation of the RNA structure information by emending NSSEL labels, the new labels （E-NSSEL） can express plane pseudoknot. A
Key words: SVM,E-NSSEL labels, RNA secondary structure, Plane pseudoknots
何静媛 何中市 邹东升. RNA二级结构预测的支持向量机模型研究[J]. 计算机科学, 2008, 35(4): 181-183. https://doi.org/
HE Jing-Yuan, HE Zhong-Shi, ZOU Dong-Sheng （College of Computer Science, Chongqing University, Chongqing 400044）. [J]. Computer Science, 2008, 35(4): 181-183. https://doi.org/
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