基因组序列中转录始点的预测方法研究

计算机科学 ›› 2005, Vol. 32 ›› Issue (12): 151-154.

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基因组序列中转录始点的预测方法研究

张慧陈恩红童庆

中国科学技术大学计算机系,合肥230027

出版日期:2018-11-17 发布日期:2018-11-17
基金资助:
本文研究得到国家自然科学基金资助（60005004）和安徽省自然科学基金资助（01042302）.

ZHANG Hui, CHEN En-Hong, TONG Qing （Department of Computer Science, University of Science and Technology of China, Hefei 230027）

Online:2018-11-17 Published:2018-11-17

摘要/Abstract

摘要： 在生物信息学领域，基因组序列上转录始点预测是基因序列预测中重要而困难的问题。本文结合了基因序列中有重要生物意义的功能点的特征，设计了一个新算法，预测基因组序列中转录始点的位置。该算法利用权重矩阵以及判别分析方法，根据训练实例进行学习，获得判别函数用于预测。实验结果表明，本文方法具有较好的预测效果。

关键词: 转录始点判别分析权重矩阵

Abstract: Prediction of transcription start site in a genomic sequence is difficult but important in the field of gene prediction in bioinformatics. A novel algorithm is presented by integrating the features of some meaningful sites in a genomic sequence to predict

Key words: Transcription start site, Discriminant analysis,Weight matrix

张慧陈恩红童庆. 基因组序列中转录始点的预测方法研究[J]. 计算机科学, 2005, 32(12): 151-154. https://doi.org/

ZHANG Hui, CHEN En-Hong, TONG Qing （Department of Computer Science, University of Science and Technology of China, Hefei 230027）. [J]. Computer Science, 2005, 32(12): 151-154. https://doi.org/

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