计算机科学 ›› 2007, Vol. 34 ›› Issue (9): 163-166.

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利用混沌差分进化算法预测RNA二级结构

  

  • 出版日期:2018-11-16 发布日期:2018-11-16
  • 基金资助:
    国家自然科学基金重点项目(编号:30230350)资助、广东省自然科学基金(编号:06301003)资助.

  • Online:2018-11-16 Published:2018-11-16

摘要: RNA二级结构预测在生物信息学中具有重要意义。本文针对RNA二级结构预测,提出了一种混沌差分进化算法。算法对种群进行混沌初始化,利用混沌扰动产生新的个体,缩小搜索空间;根据个体的适应值和种群密度自适应地对个体进行混沌更新,改善了种群的多样性。该算法充分利用了差分进化算法速度快以及混沌的遍历性、随机性和规律性等特点,有效克服了早熟现象,提高了算法的全局搜索能力。实验证明了算法的有效性。

关键词: RNA二级结构 生物信息学 差分进化算法 混沌

Abstract: The prediction of RNA secondary structure has important significance in bioinformatics. A chaos differential evolution (CDE)has been proposed for prediction of RNA secondary structure. The basic principle of CDE is that population is initialized by chaos,

Key words: RNA secondary structure, Bioinformatics, Differential evolution(DE),Chaos

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